Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSLP07711 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSLP07711 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSLP07711 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSLP07711 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSLP07711 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSLP07711 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSLP07711 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSLP07711 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSLP07711 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSLP07711 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSLP07711 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSLP07711 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSLP07711 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSLP07711 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSLP07711 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSLP07711 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSLP07711 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms