Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSNP06396 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSNP06396 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSNP06396 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSNP06396 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GSNP06396 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GSNP06396 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GSNP06396 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSNP06396 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSNP06396 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSNP06396 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GSNP06396 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GSNP06396 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSNP06396 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSNP06396 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSNP06396 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GSNP06396 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GSNP06396 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GSNP06396 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GSNP06396 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GSNP06396 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms