Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MYCNP04198 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MYCNP04198 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYCNP04198 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYCNP04198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYCNP04198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYCNP04198 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYCNP04198 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYCNP04198 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYCNP04198 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYCNP04198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYCNP04198 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYCNP04198 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYCNP04198 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYCNP04198 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYCNP04198 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYCNP04198 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYCNP04198 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYCNP04198 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms