Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGAP02671 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGAP02671 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGAP02671 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGAP02671 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGAP02671 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGAP02671 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGAP02671 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGAP02671 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGAP02671 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FGAP02671 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGAP02671 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGAP02671 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGAP02671 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGAP02671 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FGAP02671 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGAP02671 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGAP02671 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGAP02671 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGAP02671 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGAP02671 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGAP02671 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGAP02671 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGAP02671 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGAP02671 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGAP02671 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FGAP02671 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGAP02671 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms