Protein–RNA interactions for Protein: P01763

IGHV3-48, Immunoglobulin heavy variable 3-48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-48P01763 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-48P01763 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-48P01763 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms