Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCNTO95613 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNTO95613 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCNTO95613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCNTO95613 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCNTO95613 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNTO95613 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNTO95613 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNTO95613 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCNTO95613 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNTO95613 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNTO95613 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNTO95613 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PCNTO95613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCNTO95613 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNTO95613 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNTO95613 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNTO95613 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCNTO95613 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCNTO95613 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCNTO95613 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCNTO95613 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms