Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN9O95484 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN9O95484 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN9O95484 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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