Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX3O95076 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX3O95076 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALX3O95076 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALX3O95076 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALX3O95076 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALX3O95076 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ALX3O95076 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ALX3O95076 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ALX3O95076 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ALX3O95076 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ALX3O95076 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ALX3O95076 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ALX3O95076 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ALX3O95076 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms