Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RHOBTB3O94955 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOBTB3O94955 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOBTB3O94955 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms