Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDKL5O76039 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDKL5O76039 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDKL5O76039 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms