Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H2AFYO75367 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H2AFYO75367 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms