Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NIPSNAP2O75323 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPSNAP2O75323 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPSNAP2O75323 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms