Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP12O75317 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP12O75317 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP12O75317 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP12O75317 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP12O75317 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP12O75317 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP12O75317 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP12O75317 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP12O75317 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP12O75317 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP12O75317 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP12O75317 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP12O75317 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP12O75317 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP12O75317 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP12O75317 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP12O75317 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP12O75317 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP12O75317 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP12O75317 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP12O75317 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP12O75317 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP12O75317 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms