Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SH3BP5O60239 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BP5O60239 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BP5O60239 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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