Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX1O43933 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX1O43933 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX1O43933 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX1O43933 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX1O43933 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX1O43933 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX1O43933 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX1O43933 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX1O43933 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX1O43933 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX1O43933 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX1O43933 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX1O43933 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX1O43933 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX1O43933 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX1O43933 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX1O43933 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX1O43933 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX1O43933 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX1O43933 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms