Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP9BO43861 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP9BO43861 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP9BO43861 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms