Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LANCL1O43813 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LANCL1O43813 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LANCL1O43813 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LANCL1O43813 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LANCL1O43813 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LANCL1O43813 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LANCL1O43813 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms