Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT86O43790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT86O43790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT86O43790 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT86O43790 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT86O43790 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT86O43790 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT86O43790 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT86O43790 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT86O43790 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT86O43790 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT86O43790 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT86O43790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT86O43790 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT86O43790 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT86O43790 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT86O43790 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms