Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBDO15205 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBDO15205 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBDO15205 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBDO15205 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBDO15205 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBDO15205 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBDO15205 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBDO15205 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBDO15205 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBDO15205 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBDO15205 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBDO15205 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBDO15205 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBDO15205 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBDO15205 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBDO15205 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBDO15205 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBDO15205 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBDO15205 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms