Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GIPC1O14908 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIPC1O14908 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIPC1O14908 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms