Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME4O00746 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME4O00746 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME4O00746 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME4O00746 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME4O00746 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME4O00746 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NME4O00746 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NME4O00746 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME4O00746 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME4O00746 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME4O00746 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NME4O00746 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms