Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF4O00268 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF4O00268 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4O00268 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4O00268 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF4O00268 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF4O00268 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TAF4O00268 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF4O00268 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF4O00268 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF4O00268 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4O00268 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF4O00268 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF4O00268 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF4O00268 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4O00268 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4O00268 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4O00268 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4O00268 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF4O00268 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF4O00268 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF4O00268 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms