Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NACAE9PAV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NACAE9PAV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NACAE9PAV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms