Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP99D6REC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP99D6REC4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP99D6REC4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms