Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B4DXG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B4DXG7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DXG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DXG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DXG7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B4DXG7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
B4DXG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B4DXG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4DXG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4DXG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B4DXG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DXG7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DXG7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DXG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B4DXG7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B4DXG7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B4DXG7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B4DXG7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DXG7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
B4DXG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B4DXG7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B4DXG7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DXG7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DXG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DXG7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B4DXG7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DXG7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms