Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms