Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC10BA6NIK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC10BA6NIK2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms