Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HELTA6NFD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms