Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3B2A6NCE7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3B2A6NCE7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms