Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSDA5PKW4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PSDA5PKW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PSDA5PKW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSDA5PKW4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms