Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBA6A0AVT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBA6A0AVT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms