Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
A0A1W2PQD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
A0A1W2PQD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A1W2PQD8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms