Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms