Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9Y3F1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.4 ms