Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HDGFL3Q9Y3E1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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