Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFR3BQ9Y2G0 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFR3BQ9Y2G0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms