Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GDE1Q9NZC3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GDE1Q9NZC3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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