Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms