Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms