Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBB2BQ9BVA1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms