Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCMBPQ9BTE3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms