Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM12Q96EX1 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM12Q96EX1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms