Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms