Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOPBP1Q92547 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms