Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACAD11Q709F0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms