Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC102BQ68D86 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms