Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRIP1Q5VSL9 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms