Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAB6CQ53S08 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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