Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC38Q502W7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms