Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGSM1Q2NKQ1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGSM1Q2NKQ1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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