Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PCSK7Q16549 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK7Q16549 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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